Все скрипты выполняются по наступлению какого-либо события. Например OnClick, или OnDataChange. Т.е. если сначала пользователь кликнул объект, затем снова кликнул объект, затем изменилась переменная, то скрипты в такой же последовательности и выполнятся: OnClick, OnClick, OnDataChange. Если говорить о секундных скриптах, то они также выполняются последовательно, в том порядке, в котором были созданы.