Здравствуйте.
Скорее всего это не связано с обновлением и причина в чем-то другом, т.к. система сообщений и звука не затрагивалась в обновленной версии. Недавно один из пользователей писал о подобной проблеме и она решилась обычной перезагрузкой компьютера. Если это не помогает, то уточните проигрывается ли звук если прослушать его через Редактор, в меню Проект -> Настройки -> Сообщения? Также уточните: Вы говорите о сообщениях, которые автоматически генерируются скадой по аварийным предупр. уровням? Или о сообщениях которые Вы создали через меню "Проект -> Сообщения"?