Здравствуйте.
Отчеты и их построение никак не влияют на значения переменных. Если переменная изменяется, то возможно в нее записывается значение из скрипта, либо с ПЛК (если переменная внешняя). Если разобраться не получится, то пришлите на support@simple-scada.com текущую версию проекта для проверки.