Если скада и OPC сервер будут работать на одном компьютере, то можно и в оконном режиме. Если у вас клиент скады и серверная часть разделены, то OPC сервер, в таком случае можно использовать как службу.
По умолчанию, автозапуск OPC сервера, как служба, отключен, т.е. он работает как оконное приложение.
Но судя по внешнему виду OPC сервера, что не так сработало. Можете прислать ещё файл settings.xml? Находится в папке C:\ProgramData\arOPC.
И там ещё должны быть файл(ы) с расширением el, их то же, если не затруднит.
Айрат