Здравствуйте.
В портах которые выведены на корпус всё отлично определяется и работает. Любые носители (дисковые накопители, флешки и т.д.) при установке в порт на плате определяются и нормально работают. Можете подсказать в чём может быть причина?
В чем именно причина сказать сложно, но в любом случае имеются какие-то отличия в работе USB порта на материнской плате и на корпусе ПК. Возможно для данного порта есть какие-то отдельные настройки в BIOS. Поищите описание этого USB-порта в документации материнской платы, возможно в его работе имеются какие-либо особенности. Если используется виртуальная машина, то возможно данный порт нужно пробросить в нее.
Также, у производителя USB-ключей Guardant можно приобрести (на странице "
Цены и заказ" в разделе "Аксессуары") переходник для установки USB-ключа внутри корпуса ПК - подробнее
см. по ссылке. Такой переходник можно подключить к стандартным USB коннекторам материнской платы.