Здравствуйте.
Настройки параметров сервера хранятся в директории "%ProgramData%\Simple-Scada 2\" в файле "Options.ini". Убедитесь, что все пользователи, под которыми необходимо выполнять настройку сервера, имеют доступ на чтение/запись файлов в данную директорию.
Настройки параметров клиента и редактора (индивидуальные для каждого пользователя Windows) хранятся в директории "C:\Users\Имя_пользователя\AppData\Roaming\Simple-Scada 2" в файле "Options.ini".